Vaasan keskussairaala, laboratorio-ohjekirja

Se även / Ks. myös: Ohjekirjan etusivu | Aakkosellinen luettelo | Aiheenmukainen lista | Päivitykset | Tiedotteet

Bm-SIL-TAL1-fuusiogeeni, kvant. jäännöstautianalyysi luuytimestä (13471 Bm-SIL-QD )

Tarkistettu

15.10.2018

Tekopaikka

TYKS Laboratoriotoimialue / Molekyylihematologia.

Yleistä

Molekyyligeneettisessä jäännöstautianalyysissä käytetään hyväksi TaqMan-PCR-tekniikkaa ja alleelispesifistä PCR-aluketta (ASO-PCR), joka on suunniteltu diagnoosivaiheen DNA-näytteestä tunnistetun SIL-TAL1 -fuusiogeenin junktiokohtaan. Jäännöstautianalyysissä diagnoosivaiheen näytettä käytetään log-lineaarisen laimennossarjan ja tästä muodostettavan standardisuoran valmistamiseen. Seurantanäytteiden jäännöstauti kvantifioidaan tältä standardisuoralta, ja mikäli näyte on jäännöstaudin suhteen negatiivinen, analyysin herkkyysraja määritetään tämän laimennossarjan perusteella. Yleensä SIL-TAL1 -fuusiogeeniin kohdistetulla ASO-alukkeella on päästävissä 0,01-0,001%:n herkkyyteen.

Indikaatiot

SIL-TAL1 -fuusiogeenipositiivisen akuutin T-soluisen leukemian/lymfooman jäännöstautianalytiikka.

Esivalmistelut

Näyte voidaan ottaa vain maanantaista torstaihin klo 14 mennessä, ei arkipyhää edeltävänä päivänä. Tutkimus on tehtävissä myös verestä, ks. 13472 B -SIL-QD.

Menetelmä

Kvantitatiivinen TaqMan-PCR.

Tulos valmiina

Kahden viikon kuluessa.

Näyteastia

4 ml CPT-putki. Suositeltava putkityyppi: BD Vacutainer CPT with Sodium Citrate, 4 mL draw capacity.

Näytteenotto

Sitraattiruiskulla n. 3 ml luuydinaspiraattia CPT-putkeen. Heti näytteenoton jälkeen sekä ennen sentrifugointia putkea tulee käännellä 8-10 kertaa ylösalaisin. Sentrifugointi (30 min, 1600 g, huoneenlämpö 18-25 °C) kahden tunnin sisällä näytteenotosta. Sentrifugoinnin jälkeen käännetään avaamaton putki 5-10 kertaa ylösalaisin.

Näyte (minimi)

4 ml (3 ml) luuydintä.

Näytteen lähetys

Ma-to huoneenlämmössä postin pikapakettina.

Tulkinta

Lausunto.

Yhteyshenkilöt

TYKS Laboratoriotoimialue

Sairaalageneetikot: 050 515 0361, (02) 313 3897, 050 340 8701, (02) 313 7156

Lääkärit: 050 597 2027, 050 411 2237

Vaasan KS: Kemisti Jukka Salminen p. (06\) 213 2529

Muutokset

*15.10.2018 Uusi tutkimus