Vaasa, laboratorio-ohjekirja

Tarkistettu

15.10.2018

Analysoiva laboratorio

TYKS Laboratoriotoimialue/Molekyylihematologia.

Yleistä

Diagnoosivaiheen näytteestä valmistetusta komplementaarisesta DNA:sta (cDNA) etsitään Europe Against Cancer (EAC) -protokollan (Gabert et al. Leukemia 2003) mukaisilla alukeyhdistelmillä yleisimpiä ALL:ssa tai AML:ssa esiintyviä kromosomimuutoksia tutkimalla näihin muutoksiin liittyviä fuusiogeenejä.

ALL-seulonnassa tutkitaan TaqMan-PCR-menetelmällä seuraaviin kromosomimuutoksiin liittyvien fuusiogeenien valtalähetit:

Kromosomimuutos	Geenifuusio	Tutkittavat lähettityypit
t(9:22)(q34:q11)	BCR-ABL	M-bcr (major b2a2, b3a2), m-bcr (minor e1a2)
t(12:21)(p13:q22)	TEL-AML1	e5e2, e5e3
t(4:11)(p13:q22)	MLL-AF4	e9e5,e9e4,e10e5,e10e4,e11e5,e11e4
t(1:19)(q23:p13)	E2A-PBX1	e13e2
del(1)(p32)	SIL-TAL1	e1be3, e1ae3

AML-seulonnassa tutkitaan TaqMan-PCR-menetelmällä seuraaviin kromosomimuutoksiin liittyvien fuusiogeenien valtalähetit:

Kromosomimuutos	Geenifuusio	Tutkittavat lähettityypit
t(15:17)(q22:q21)	PML-RARA	bcr1, bcr2, bcr3
t(8:21)(q22:q22)	AML1-ETO	e5e2
inv(16)(p13:q22)	CBFB-MYH11	A, D, E
t(9:22)(q34:q11)	BCR-ABL	M-bcr (major), m-bcr (minor).

Indikaatiot

Akuutteihin leukemioihin liittyvien yleisimpien fuusiogeenien osoitus diagnoosi- tai relapsivaiheen likvornäytteestä.

Menetelmä

Kvantitatiivinen PCR (TaqMan).

Tulos valmiina

Kahden viikon kuluessa.

Näyteastia

Säilöntäaineeton 5/4 ml Vacuette tuotenumero 454001 (valkoinen korkki)

Näyte (minimi)

2-3 ml likvoria (2 solupellettiä).

Ohje laboratoriolle

Likvornäyte jaetaan kahteen lähetysputkeen jotka sentrifugoidaan mahdollisimman nopeasti 10min/450 g. Supernatantti poistetaan (solunapin päälle voi jäädä nestettä) ja putket pakastetaan välittömästi -70 °C.

Näytteen säilytys

Pakastettuna -70 °C.

Näytteen lähetys

Ma-to kuivajäissä postin pikapakettina.

Tulkinta

Tuloksesta annetaan lausunto.

Lisätietoja

Ammattilaisneuvonta Pohjanmaa 041 7314 786

Muutokset

*15.10.2018 Uusi tutkimus