Vaasa, laboratorio-ohjekirja

Tarkistettu

6.6.2022

Tekopaikka

TYKS Laboratoriotoimialue/906 Bakteerilaboratorio (02) 313 1675 tai mikrobiologi 046 922 1871.

Yleistä

Patogeenisten bakteerien tunnistus tapahtuu osoittamalla kullekin taudinaiheuttajalle ominaisen geenimarkkerin läsnäolo näytteestä.Tutkimus tunnistaa yhdestä näytteestä samanaikaisesti seuraavat ulostepatogeenit: Salmonella Campylobacter (lajit jejuni, coli) Campylobacter-lajien osalta tutkimus tunnistaa suluissa mainitut lajit, mutta ei erottele niitä toisistaan. Shigella/EIEC (enteroinvasiivinen E.coli) EHEC (enterohemorraaginen E.coli) ETEC (enterotoksigeeninen E.coli) Vibrio spp. (vulnificus/parahaemolyticus/cholerae) Plesiomonas shigelloides Yersinia enterocolitica Tutkimus ei erottele toisistaan Shigella-lajeja ja enteroinvasiivista E.colia (EIEC). EHEC-bakteerin osoittaminen näytteestä perustuu stx1/stx2-geenimarkkerien detektioon.

Indikaatiot

Bakteeriperäiseksi epäillyn ripulin aiheuttajan selvittäminen.

Menetelmä

Multiplex-PCR.

Tulos valmiina

PCR-testin tulokset saadaan viimeistään seuraavana arkipäivänä. PCR-positiivisista näytteistä (Ei ETEC) tehdään ilman erillistä lisäpyyntöä jatkotutkimuksena bakteeriviljely, lajityypitys ja antibioottiherkkyysmääritys (Ei EHEC).

Näyte (minimi)

Ulostenäytettä eSwab putkeen (eSwab 490CE.A). Pyörittele eSwab-näytteenottotikkua ulostenäytteessä, vältä liian runsasta näytettä. Jos uloste on nestemäistä, pidä tikkua hetken nestemäisessä ulosteessa. Siirrä tikku välittömästi näytteenoton jälkeen eSwab-kuljetusputkeen ja katkaise tikku katkaisukohdasta. Ulostenäyte voidaan ottaa myös Fecal swab-putkeen (470CE).

Näytteen säilytys

eSwab:ssa otettu näyte säilyy huoneenlämmössä 5 vrk. Fecal swabissa näyte säilyy huoneenlämmössä 2 vrk ja jääkaappilämpötilassa 3 vrk.

Näytteen lähetys

Ma-pe huoneenlämmössä. Lähetetään iskulta suojattuna mahdollisimman pian.

Tulkinta

Tutkimus koostuu seuraavista osatutkimuksista Sh/EIECNhO, CampNhO, EHECNhO, SalmNhO, VibrNhO, PlesNhO, YersNhO, ETECNhO. Tulokset vastataan analyyttikohtaisesti positiivisena tai negatiivisena.

Yhteyshenkilöt

Fimlab Vaasa: Sairaalamikrobiologi Roosa Jämsén p. 041 730 3503, ylilääkäri Suvi-Sirkku Kaukoranta p. 041 730 3918

Muutokset

*16.10.2019 lisätty avainsanat ja selite
*6.6.2022 lisätty fecalswab näytteenottotiedot ja päivitetty tulkinta ja jatkoviljelyinfoa