Tarkistettu

15.5.2019

Tekopaikka

TYKS Laboratoriotoimialue/906 Bakteerilaboratorio (02) 313 1675.

Yleistä

Patogeenisten bakteerien tunnistus tapahtuu osoittamalla kullekin taudinaiheuttajalle ominaisen geenimarkkerin läsnäolo näytteestä.Tutkimus tunnistaa yhdestä näytteestä samanaikaisesti seuraavat ulostepatogeenit: Salmonella Campylobacter (lajit jejuni, coli) Campylobacter-lajien osalta tutkimus tunnistaa suluissa mainitut lajit, mutta ei erottele niitä toisistaan. Shigella/EIEC (enteroinvasiivinen E.coli) EHEC (enterohemorraaginen E.coli) ETEC (enterotoksigeeninen E.coli) Vibrio spp. (vulnificus/parahaemolyticus/cholerae) Plesiomonas shigelloides Yersinia enterocolitica Tutkimus ei erottele toisistaan Shigella-lajeja ja enteroinvasiivista E.colia (EIEC). EHEC-bakteerin osoittaminen näytteestä perustuu stx1/stx2-geenimarkkerien detektioon.

Indikaatiot

Bakteeriperäiseksi epäillyn ripulin aiheuttajan selvittäminen.

Menetelmä

Multiplex-PCR.

Tulos valmiina

PCR-testin tulokset saadaan viimeistään seuraavana arkipäivänä.

Näyte (minimi)

Ulostenäytettä eSwab putkeen (eSwab 490CE.A). Pyörittele eSwab-näytteenottotikkua ulostenäytteessä, vältä liian runsasta näytettä. Jos uloste on nestemäistä, pidä tikkua hetken nestemäisessä ulosteessa. Siirrä tikku välittömästi näytteenoton jälkeen eSwab-kuljetusputkeen ja katkaise tikku katkaisukohdasta.

Näytteen säilytys

Näyte säilyy huoneenlämmössä 5 vrk.

Näytteen lähetys

Ma-pe huoneenlämmössä. Lähetetään iskulta suojattuna mahdollisimman pian.

Tulkinta

Tutkimus koostuu seuraavista osatutkimuksista. Kukin vastataan erikseen. Sh/EIECNhO, CampNhO, EHECNhO, SalmNhO, VibrNhO, PlesNhO, YersNhO, ETECNhO.

Yhteyshenkilöt

TYKS: Ylilääkäri Erkki Eerola p. 050 463 7260.

Vaasan KS: Mikrobiologi Roosa Savolainen p. 041 730 3503, ylilääkäri Suvi-Sirkku Kaukoranta p. (06) 213 2840