Vaasan keskussairaala, laboratorio-ohjekirja

Se även / Ks. myös: Ohjekirjan etusivu | Aakkosellinen luettelo | Aiheenmukainen lista | Päivitykset | Tiedotteet

F -Clostridium difficile, kannan tyypitys (8056 F -CldiTy )

Tarkistettu

25.03.2014

Tekopaikka

HUSLAB/Bakteriologian osasto, puh. (09) 191 26237.

Yleistä

Eristetyn bakteerikannan genomista osoitetaan toksiinia tuottavalle kannalle ominaiset tcdA- ja tcdB-geenit, ns. hypervirulenteilla kannoilla tavattavat binääritoksiinigeenit cdtA ja cdtB sekä hypervirulentille ribotyypin 027 kannoille ominaiset muutokset toksiinin tuoton säätelygeenissä tcdC. Testillä voidaan havaita myös muunlaisia poikkeuksellisia toksiinityyppejä, esim. ribotyypille 078 ominaiset geenimuutokset.

Indikaatiot

Clostridium difficile -löydöksen tarkempi tyypittäminen.

Esivalmistelut

Tutkimusta tilaa ainoastaan laboratorio.

Menetelmä

Toksiinigeeneihin perustuva tyypitysmenetelmä. Perinteinen PCR-menetelmä, jossa monistetaan seitsemän eri geenialuetta.

Tekotiheys

2-3 kertaa viikossa.

Näyte (minimi)

Ulostenäyte CldiVTx-tutkimukseen tai eristetty Clostridium difficile -kanta maljalla tai geelikuljetusputkessa. Tutkimuksen voi tehdä myös sekaviljelmästä.

Tulkinta

Kannalle vastataan lausuntona, omaako se hypervirulentille ribotyypin 027 kannalle ominaiset virulenssiominaisuudet vai ei. Erityisestä toivomuksesta kommentoidaan myös muut mahdolliset poikkeukselliset ominaisuudet (esim. tcdC-geenin ns. suuret deleetiot), joista saattaa olla lisähyötyä esim. löydösten vertailussa.

Yhteyshenkilöt

Mikrobiologi Roosa Savolainen p. 041 730 3503, ylilääkäri Suvi-Sirkku Kaukoranta p. (06) 213 2840.