Vaasa, laboratorio-ohjekirja

Tarkistettu

31.01.2024

Analysoiva laboratorio

Fimlab Tampere/Kliinisen genetiikan laboratorio, puh. 03-311 75809, sairaalageneetikot puh. 03-311 75937, 046-923 6332.

Yleistä

FLT3- ja NPM1-geenien yhdistelmätutkimuksella eli Bm-AMLpika‐nimikkeellä voidaan tilata FLT3- ja NPM1-geenien tyyppimutaatioiden osoitus tehtäväksi akuutin myelooisen leukemian diagnoosivaiheessa samanaikaisesti kiiretutkimuksina. Tutkimuksella voidaan osoittaa FLT3-geenin eksoniin 14 paikantuvat pituusmutaatiot (ITD), TKD-alueen kodonin Asp835 mutaatiot sekä NPM1-geenin eksonin 11 (ref. NM_002520.7) pituusmutaatiot.

Kromosomissa 13 sijaitsevan FLT3-geenin mutaatioita esiintyy mm. akuutissa myelooisessa leukemiassa (AML), myelodysplastisessa syndroomassa (MDS) ja akuutissa lymfoblastileukemiassa. FLT3-geeni koodaa reseptorityrosiinikinaasia ja geenin toiminta liittyy solujen kasvun säätelyyn. FLT3-geenin mutaatiot ovat useimmiten lyhyitä, 3-400 emäsparin pituisia duplikaatioita, jotka paikantuvat eksoniin 14. AML:ssä näitä duplikaatioita esiintyy noin 20-30 %:lla potilaista, MDS:ssä noin 10-20 %:lla. Toinen yleinen FLT3-geenin mutaatiotyyppi ovat kodoniin 835 osuvat mutaatiot, jotka tavallisimmin muuttavat kodonin 835 koodaaman aspartaatin (D) joksikin muuksi aminohapoksi. Kodonin 835 pistemutaatioita esiintyy n. 5-10 %:lla AML-potilaista. FTL3-geenin mutaatiot ovat leukemogeneesiin liittyviä sekundaaripoikkeavuuksia, joista etenkin pituusmutaatiot yhdistetään huonoon ennusteeseen. FLT3-geenin mutaatioita voidaan tarvittaessa käyttää molekyyligeneettisinä jäännöstautimarkkereina.

Kromosomissa 5 sijaitseva nukleofosmiinigeeni (NPM1) koodaa multifunktionaalista fosfoproteiinia, jolla on tärkeä rooli sekä ribosomin biogeneesissä että sentrosomin kahdentumisessa. Lisäksi sen oletetaan osallistuvan myös p19-p53- tuumorisupressoriproteiini -reaktioketjujen säätelyyn. Nukleofosmiiniproteiini sukkuloi tuman ja sytoplasman välillä ja sitä on tavallisesti runsaimmin nukleoluksessa. Noin kolmanneksella primääristä AML:aa sairastavista on havaittavissa mutaatioita nukleofosmiinigeenissä, mikä aiheuttaa proteiinin sytoplasmisen lokalisaation.

Indikaatiot

AML-taudin diagnoosivaihe, kun FLT3- ja NPM1-geenien mutaatiostatus halutaan selvittää kiiretutkimuksina samanaikaisesti.

Näyteastia

4 ml CPT-putki.

Näytteenotto

Heti näytteenoton jälkeen sekä ennen sentrifugointia putkea tulee kääntää 8-10 kertaa ylösalaisin. Sentrifugointi (30 min, 1600 g, huoneenlämpö 18-25 °C) kahden tunnin sisällä näytteenotosta. Sentrifugoinnin jälkeen käännetään avaamaton putki 5-10 kertaa ylösalaisin.

Näyte (minimi)

1 ml luuydintä aseptisesti 6 ml EDTA-putkeen.

Näytteen lähetys

Putket voidaan lähettää huoneenlämmössä normaalina yön yli postina.

Lisätietoja

Ammattilaisneuvonta Pohjanmaa 041 7314 786

Muutokset

*31.01.2024 Uusi tutkimus.