Vaasa, laboratorio-ohjekirja

Tarkistettu

31.8.2023

Analysoiva laboratorio

Fimlab laboratoriot oy/genetiikan laboratorio (03) 3117 5424, sairaalageneetikko puh. (03) 3117 5937.

Yleistä

Tutkimuksella määritetään kvantitatiivisesti potilaalla diagnoosivaiheessa todetun fuusiogeenin määrä seurantavaiheen näytteessä. Tämä fuusiotranskriptiin perustuva jäännöstautianalyysi on mahdollista seuraaville fuusiogeeneille:

• BCR::ABL1

• CBFB::MYH11

• TCF3::PBX1

• RUNX1::RUNX1T1

• KMT2A::AFF1

• PML::RARA

• STIL::TAL1

• ETV6::RUNX1

• DEK::NUP214

Näyteastia

4 ml CPT-natriumsitraattiputki (musta-sininen korkki). Saa laboratoriosta. CPT-natriumsitraattiputket tilataan Fimlabista puh. (03) 3117 5328 ja säilytetään huoneenlämmössä.

Näytteenotto

Näyte on suojattava valolta kaikissa käsittelyvaiheissa. Foliokääre tai muu valonpitävä suoja. Näytteet on sekoitettava heti näytteenoton jälkeen "hellästi" 8 kertaa.

Näyte (minimi)

3 ml luuydintä CPT-natriumsitraattiputkessa sentrifugoituna. Suojattava valolta. Ks. Ohje laboratoriolle. Tutkimukseen suositellaan verinäytettä (9849 B -Fuus-qR). Määritys on mahdollista tehdä luuytimestä, mutta seurannan vertailukelpoisuuden vuoksi seuranta tulisi tehdä mielellään aina samasta näytetyypistä.

Ohje laboratoriolle

CPT-putket sekoitetaan juuri ennen sentrifugointia kääntämällä ne ylösalaisin 10 kertaa. CPT-putket sentrifugoidaan 1800 g 20 min, minkä jälkeen putkia käännellään uudelleen ylösalaisin 10 kertaa. CPT-putkea ei saa pakastaa tai avata enää sentrifugoinnin jälkeen. Sentrifugoidut putket säilytetään ja lähetetään huoneenlämmössä valolta suojattuna.

Näytteen säilytys

Huoneenlämmössä valolta suojattuna.

Näytteen lähetys

Ma - to huoneenlämmössä styrox-kotelossa.

Tulkinta

Tutkimuksesta annetaan lausunto. Lausunnosta ilmenee mahdollisen jäännöstaudin määrä suhteessa potilaan diagnoosivaiheen näytteeseen. Mikäli diagnoosivaiheen näytettä ei ole käytettävissä, käytetään Europe Against Cancer (EAC) -organisaation raportoimia mediaaniarvoja. Tulos normalisoidaan GUSB (glucuronidase beta) -geenin suhteen. Negatiivisen tuloksen yhteydessä ilmoitetaan PCR-ajossa saavutettu herkkyys.

Lisätietoja

Ammattilaisneuvonta Pohjanmaa 041 7314 786

Muutokset

*31.8.2023 uusi tutkimusnumero.